De grundlæggende enheder i FagLab RUC er de fagdidaktiske miljøer. Et fagdidaktisk miljø består af en gruppe forskere der forstår sig selv som medlemmer af en mere eller mindre permanent fagdidaktisk gruppe eller et forskningsprojekt. Det er medlemmerne af det fagdidaktiske miljø der afgør at de forstår sig som medlemmer af et sådant miljø.